MIPT Bioinformatics Club #1

Dasha Romanovskaya about Nature paper “Predicting the sequence specificities of DNA- and RNA-binding proteins by deep learning”

“В статье предложен новый метод на основе глубокого обучения для поиска сайтов связывания РНК- и ДНК - связывающихся белков, которые являются регуляторами экспрессии генов.

Метод основан на сверточных нейронных сетях, с помощью которых каждой последовательности присваивается какой-то скор по афинности.

Как результат - это крайне точный метод, работающий лучше, чем существующие программы для поиска биологических мотивов в ДНК или РНК. Полезной надстройкой является визуализация карты потенциально патогенных мутаций.”